Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprkP35822 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprkP35822 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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