Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
RxraP28700 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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