Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TtrP07309 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TtrP07309 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TtrP07309 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms