Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
H2-Q1O19441 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms