Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms