Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Rcbtb2-218ENSMUST00000169479 3351 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 CT009536.1-201ENSMUST00000223774 2151 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm3455-201ENSMUST00000204812 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms