Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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