Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Csnka2ipQ8CH19 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Csnka2ipQ8CH19 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Csnka2ipQ8CH19 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Csnka2ipQ8CH19 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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