Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr61-204ENSMUST00000211685 1212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Pln-202ENSMUST00000163319 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Kcna4-201ENSMUST00000037012 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trim35Q8C006 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trim35Q8C006 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trim35Q8C006 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trim35Q8C006 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Cpm-201ENSMUST00000020399 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm4924-201ENSMUST00000165906 2645 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Pcdhb12-201ENSMUST00000055495 3034 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trim35Q8C006 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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