Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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NischQ80TM9 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NischQ80TM9 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NischQ80TM9 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NischQ80TM9 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NischQ80TM9 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NischQ80TM9 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NischQ80TM9 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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