Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxc13P50207 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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