Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm37675-201ENSMUST00000192303 2847 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms