Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms