Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ifnb1P01575 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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