Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Col5a3Q9JLI2 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Col5a3Q9JLI2 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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Col5a3Q9JLI2 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Col5a3Q9JLI2 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Col5a3Q9JLI2 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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