Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnft1Q9DCN7 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnft1Q9DCN7 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnft1Q9DCN7 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnft1Q9DCN7 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnft1Q9DCN7 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnft1Q9DCN7 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnft1Q9DCN7 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnft1Q9DCN7 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Rnft1Q9DCN7 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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