Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 6430550D23Rik-202ENSMUST00000109617 1872 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Crp-201ENSMUST00000038495 1695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Trim43a-201ENSMUST00000164661 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Cntrl-202ENSMUST00000028237 7615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm18513-201ENSMUST00000177313 560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Uba3-202ENSMUST00000164744 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Riok3Q9DBU3 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms