Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Npy5r-201ENSMUST00000070810 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Sept2-213ENSMUST00000168776 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Runx1t1-202ENSMUST00000098256 3317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms