Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Magi2-215ENSMUST00000208219 3266 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms