Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Ercc8Q8CFD5 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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