Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NischQ80TM9 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms