Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Agxt2-201ENSMUST00000022858 1825 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm44610-201ENSMUST00000209012 3827 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 D230017M19Rik-203ENSMUST00000181973 1649 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm39459-201ENSMUST00000215662 1895 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Ighe-202ENSMUST00000223335 1460 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ctrcos-201ENSMUST00000128368 322 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm20394-201ENSMUST00000173304 942 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm20686-201ENSMUST00000175846 535 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ceacam10-203ENSMUST00000206847 662 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Anapc15-ps-202ENSMUST00000218771 399 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Rpusd1-201ENSMUST00000047273 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Mcm5-201ENSMUST00000164309 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm23195-201ENSMUST00000158814 129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Lrrc43Q3V0L5 Mylpf-201ENSMUST00000032910 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms