Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37787-201ENSMUST00000192524 585 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6637-201ENSMUST00000204884 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44928-201ENSMUST00000208098 128 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8948-201ENSMUST00000216371 370 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 AC090654.1-201ENSMUST00000225584 1071 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr572-201ENSMUST00000098214 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Katnal2-201ENSMUST00000026486 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Krt39-201ENSMUST00000076948 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Dcstamp-203ENSMUST00000227368 1825 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gabpa-202ENSMUST00000114184 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf11-202ENSMUST00000064167 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 AC113059.1-201ENSMUST00000181185 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrf1-203ENSMUST00000189545 4766 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Taf9b-202ENSMUST00000113495 2512 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10629-201ENSMUST00000137706 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Homer1-201ENSMUST00000060490 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16014-201ENSMUST00000123363 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk2ap2-203ENSMUST00000174149 386 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25196-201ENSMUST00000180171 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27199-201ENSMUST00000185026 623 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36976-201ENSMUST00000192632 1110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ddo-205ENSMUST00000214102 792 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Morn3-202ENSMUST00000045843 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Apoh-201ENSMUST00000000049 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10036-201ENSMUST00000079733 537 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Plekho2-201ENSMUST00000068944 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms