Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp39Q3TIX9 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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