Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
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Sh3bp1P55194 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
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Sh3bp1P55194 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
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