Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 St6gal1-206ENSMUST00000178797 4177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Tshz2-201ENSMUST00000109157 5083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm28447-202ENSMUST00000186677 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Pnma2-202ENSMUST00000122431 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Sept2-214ENSMUST00000172165 3192 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Scfd1-205ENSMUST00000219434 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Pln-202ENSMUST00000163319 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm37699-201ENSMUST00000194753 3338 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm5560-201ENSMUST00000086918 892 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Zfp820-201ENSMUST00000084141 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Fut10-203ENSMUST00000161502 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Wfikkn2-201ENSMUST00000061469 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Efcab3-201ENSMUST00000021029 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Sin3a-207ENSMUST00000168502 4899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 AC122197.1-201ENSMUST00000220281 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm43657-201ENSMUST00000200336 3833 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm35608-201ENSMUST00000218472 2370 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prim1P20664 AA986860-201ENSMUST00000039323 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Mgam2-ps-203ENSMUST00000216691 1709 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm8049-201ENSMUST00000214336 1782 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm16701-201ENSMUST00000181309 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Olfr718-ps1-201ENSMUST00000164536 3962 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm13666-201ENSMUST00000120032 799 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm11897-201ENSMUST00000121976 828 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prim1P20664 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms