Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm8065-201ENSMUST00000164048 605 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm3252-202ENSMUST00000178748 450 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm5981-201ENSMUST00000199912 487 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Vmn2r-ps91-201ENSMUST00000213039 784 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P10404 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms