Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
H2-Eb1P04230 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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