Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nccrp1G3X9C2 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms