Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
OtofQ9ESF1 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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