Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Txndc16-201ENSMUST00000022377 4028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms