Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Atg16l1Q8C0J2 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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