Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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NischQ80TM9 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NischQ80TM9 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NischQ80TM9 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NischQ80TM9 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NischQ80TM9 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NischQ80TM9 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NischQ80TM9 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NischQ80TM9 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NischQ80TM9 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NischQ80TM9 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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