Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm13358-201ENSMUST00000121427 569 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm12949-201ENSMUST00000143382 362 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Olfr169-202ENSMUST00000215040 2316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 St6gal1-206ENSMUST00000178797 4177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 G730013B05Rik-201ENSMUST00000180509 2176 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps87-201ENSMUST00000174393 876 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Clcn1Q64347 E030024N20Rik-201ENSMUST00000075293 494 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.7 ms