Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Ccndbp1Q3TVC7 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Ccndbp1Q3TVC7 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Ccndbp1Q3TVC7 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccndbp1Q3TVC7 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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