Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC8.27□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Sh3bp1P55194 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Sh3bp1P55194 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Sh3bp1P55194 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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Sh3bp1P55194 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Sh3bp1P55194 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Sh3bp1P55194 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
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