Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Raet1d-202ENSMUST00000182677 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zfp940-201ENSMUST00000085792 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm10639-202ENSMUST00000121273 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm12320-201ENSMUST00000127333 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC147044.1-201ENSMUST00000223850 552 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cyb5d2-203ENSMUST00000156294 2158 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tmem69-202ENSMUST00000106478 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC170188.1-201ENSMUST00000223710 1963 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Eif4enif1-201ENSMUST00000020734 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm16465-201ENSMUST00000118585 1758 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr545-202ENSMUST00000216116 3496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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