Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm28244-201ENSMUST00000189342 356 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm7442-201ENSMUST00000197778 383 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm23786-202ENSMUST00000200181 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 AC163354.1-202ENSMUST00000221460 656 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VimP20152 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm8877-201ENSMUST00000172657 655 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VimP20152 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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