Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Tro-205ENSMUST00000151403 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm11868-201ENSMUST00000121594 1478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Crtam-201ENSMUST00000034519 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Ccdc77-201ENSMUST00000032283 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp9yF8VPU6 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms