Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5538W4VSP6 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms