Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tfam-202ENSMUST00000105432 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Oprm1-217ENSMUST00000105615 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC134917.3-201ENSMUST00000222057 1283 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Catsperd-201ENSMUST00000112979 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Slc50a1-202ENSMUST00000107460 785 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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