Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Snapc3Q9D2C9 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Snapc3Q9D2C9 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms