Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Card11Q8CIS0 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms