Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm15645-202ENSMUST00000183393 1299 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm20884-201ENSMUST00000186946 693 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Olfr925-ps1-201ENSMUST00000217295 780 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Olfr452-202ENSMUST00000214465 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Txndc16-209ENSMUST00000153383 3691 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Adam1a-201ENSMUST00000100757 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Cdc25b-202ENSMUST00000079857 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Slc5a1-201ENSMUST00000011178 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Pcx-202ENSMUST00000113825 4044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Rhox12-202ENSMUST00000115146 561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm5371-201ENSMUST00000186275 1577 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Atg13-201ENSMUST00000028678 3604 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms