Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Cldn17Q8BXA6 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Cldn17Q8BXA6 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms