Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sys1Q78S06 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms