Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccdc18Q640L5 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc18Q640L5 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc18Q640L5 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc18Q640L5 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms