Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms