Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
VhlP40338 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VhlP40338 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms