Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RxraP28700 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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